一种对人类白血球抗原基因位点进行以测序为基础的分型系统及方法.docx

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算该初步分型结果的所有不确定性组合;及(iii)以解开最多的步骤(ii)所得的不确定性组合为前提,选择一或多个引物。该电脑装置可选自于,例如,由电脑系统、桌上型电脑、笔记型电脑及可携式计算装置所组成的群组。[0030]该初步分型结果可由操作者手动输入。该初步分型结果提供该HLA基因位点的一初步(或粗略)HLA型别。根据本发明,该初步分型结果提供低分辨度至中分辨度的HLA型别,其可通过一血清学方法或一以DNA为基础的方法而获得。在本发明的特定具体实施例中,该初步分型结果是通过选自于由序列特异的寡核苷酸探针法(sequence-specificoligonucleotideprobe;SS0P)、反向序列特异的寡核苷酸探针法(reversesequence-specificoligonucleotideprobe;rSS0P)、序列特异的引物法(sequence-specificprimer;SSP)及测序分型法(sequencing-basedtyping;SBT)的一以DNA为基础的方法而获得。[0031]基于该初步分型结果和可自公共资料库(例如,欧洲生物资讯研究所的頂GT/HLA资料库/imgt/hla/)获得的已知HLA等位基因型资讯,可以计算该初步分型结果的可能的不确定性组合,此亦即为来自该受测样本在PCR-SBT中所可能产生的不确定性组合。[0032]在本发明的较佳具体实施例中,可能的不确定性组合通过包含下列步骤的方法计算:(1)根据已知的HLA等位基因型,并列(