药物设计学课件 第7章肽拟似物.pdf

第七章 肽拟似物
第一节 肽的基础知识与肽拟似物
第二节 肽拟似物的设计原理与方法
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第一节 肽的基础知识与肽拟似物
肽的基础知识
氨基酸
定义： 分子中既含有氨基，又含有羧基的化合物统称为氨基酸
COOH
CH3CHCOOH NH2CH2CH2COOH NH2CH2CH2CH2COOH NH2
NH2
α-amino acid β-amino acid γ-amino acid
o-amino benzoic acid
COOH COOH
构型 H2N H H NH2
R R
L-α-amino acid D-α-amino acid
组成肽和蛋白质的结构单元分子 L-a- amino Acid
2
20种基本氨基酸
1. Nonpolar, aliphalic R groups (6)
COO- COO- COO-
+ + +
H3N H H3N H H3N H
H CH3 CH(CH3)2
Glycine (Gly) Alanine (Ala) Valine (Val)
甘氨酸 丙氨酸 缬氨酸
COO- COO- COO-
+ +
H3N H H3N H
+H N
CH2 CH(CH3) 2
CH(CH3)2 CH2CH3
Leucine (Leu) Isoleucine (Ile) Proline (Pro)
亮氨酸 异亮氨酸 脯氨酸
3
20种基本氨基酸
2. Aromatic R groups (3)
-
COO- COO COO-
+
+ H3N H +
H3N H H3N H
CH2
CH2 CH2
N
H
OH
Phenylalanine (Phe) Tyros